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La inclusión o exclusión de ciertos procesos dentro de los límites del sistema se fundamenta principalmente en el propósito de la investigación, la disponibilidad de información, la importancia ambiental y la necesidad de detalle que se requiera. Por ejemplo, se consideran aquellos procesos que tienen un efecto relevante en el ciclo de vida, como la extracción de recursos, la producción, el transporte o el uso, ya que afectan de manera directa los resultados. Por otro lado, es posible dejar fuera procesos que tengan un impacto mínimo, que sean difíciles de medir o que no sean significativos para la investigación. Esta decisión de exclusión debe basarse en criterios claros, como estudios anteriores, análisis de sensibilidad o normas metodológicas (ISO 14040 y 14044).

No obstante, esta elección repercute directamente en los resultados del Análisis de Ciclo de Vida (LCA). Si se omiten procesos importantes, la huella ambiental puede ser subestimada y las conclusiones pueden resultar sesgadas. Igualmente, incluir procesos con un alto nivel de detalle puede mejorar la precisión, pero también incrementa el tiempo, costo y complejidad del análisis. Por lo tanto, los límites del sistema necesitan estar definidos de forma coherente y ser justificados adecuadamente, puesto que estos determinan la calidad, representatividad y fiabilidad del estudio.